Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBE1Q04446 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBE1Q04446 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBE1Q04446 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBE1Q04446 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBE1Q04446 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBE1Q04446 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GBE1Q04446 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms