Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP3Q02447 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SP3Q02447 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP3Q02447 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP3Q02447 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SP3Q02447 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP3Q02447 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP3Q02447 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP3Q02447 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SP3Q02447 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP3Q02447 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP3Q02447 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP3Q02447 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SP3Q02447 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SP3Q02447 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SP3Q02447 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SP3Q02447 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SP3Q02447 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP3Q02447 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP3Q02447 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SP3Q02447 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SP3Q02447 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SP3Q02447 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SP3Q02447 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SP3Q02447 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SP3Q02447 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SP3Q02447 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SP3Q02447 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SP3Q02447 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SP3Q02447 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SP3Q02447 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SP3Q02447 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SP3Q02447 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SP3Q02447 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SP3Q02447 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SP3Q02447 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SP3Q02447 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SP3Q02447 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SP3Q02447 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SP3Q02447 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SP3Q02447 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SP3Q02447 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SP3Q02447 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SP3Q02447 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SP3Q02447 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SP3Q02447 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SP3Q02447 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SP3Q02447 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SP3Q02447 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SP3Q02447 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SP3Q02447 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SP3Q02447 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SP3Q02447 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SP3Q02447 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SP3Q02447 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SP3Q02447 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SP3Q02447 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SP3Q02447 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SP3Q02447 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP3Q02447 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP3Q02447 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP3Q02447 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SP3Q02447 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SP3Q02447 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP3Q02447 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SP3Q02447 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SP3Q02447 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SP3Q02447 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SP3Q02447 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SP3Q02447 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SP3Q02447 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SP3Q02447 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SP3Q02447 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP3Q02447 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP3Q02447 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP3Q02447 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SP3Q02447 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SP3Q02447 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SP3Q02447 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SP3Q02447 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SP3Q02447 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SP3Q02447 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SP3Q02447 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SP3Q02447 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SP3Q02447 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SP3Q02447 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP3Q02447 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP3Q02447 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms