Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF2Q01130 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF2Q01130 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF2Q01130 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF2Q01130 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF2Q01130 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms