Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCCQ00597 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FANCCQ00597 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCCQ00597 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms