Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMAD3P84022 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMAD3P84022 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD3P84022 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD3P84022 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD3P84022 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD3P84022 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms