Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHC1P78364 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHC1P78364 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHC1P78364 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHC1P78364 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHC1P78364 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHC1P78364 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHC1P78364 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHC1P78364 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHC1P78364 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC1P78364 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC1P78364 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC1P78364 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHC1P78364 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC1P78364 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC1P78364 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC1P78364 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC1P78364 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHC1P78364 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHC1P78364 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHC1P78364 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHC1P78364 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHC1P78364 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PHC1P78364 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHC1P78364 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHC1P78364 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHC1P78364 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC1P78364 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC1P78364 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC1P78364 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC1P78364 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHC1P78364 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHC1P78364 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHC1P78364 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHC1P78364 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHC1P78364 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC1P78364 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC1P78364 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC1P78364 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC1P78364 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHC1P78364 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC1P78364 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC1P78364 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC1P78364 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC1P78364 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC1P78364 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHC1P78364 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC1P78364 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC1P78364 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC1P78364 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC1P78364 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC1P78364 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHC1P78364 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC1P78364 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC1P78364 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC1P78364 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC1P78364 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHC1P78364 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC1P78364 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC1P78364 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHC1P78364 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC1P78364 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC1P78364 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC1P78364 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC1P78364 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHC1P78364 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC1P78364 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC1P78364 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC1P78364 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHC1P78364 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC1P78364 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHC1P78364 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC1P78364 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC1P78364 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC1P78364 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC1P78364 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHC1P78364 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHC1P78364 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHC1P78364 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHC1P78364 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHC1P78364 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHC1P78364 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHC1P78364 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHC1P78364 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHC1P78364 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHC1P78364 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHC1P78364 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHC1P78364 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHC1P78364 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHC1P78364 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC1P78364 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC1P78364 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC1P78364 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHC1P78364 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms