Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBXN2AP68543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBXN2AP68543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBXN2AP68543 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBXN2AP68543 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBXN2AP68543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms