Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK2A1P68400 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2A1P68400 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2A1P68400 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A1P68400 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A1P68400 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms