Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB11AP62491 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB11AP62491 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11AP62491 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11AP62491 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms