Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11AP62491 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11AP62491 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11AP62491 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11AP62491 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB11AP62491 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB11AP62491 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11AP62491 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11AP62491 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11AP62491 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11AP62491 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11AP62491 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB11AP62491 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11AP62491 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11AP62491 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11AP62491 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11AP62491 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11AP62491 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11AP62491 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11AP62491 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11AP62491 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11AP62491 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11AP62491 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11AP62491 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11AP62491 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11AP62491 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11AP62491 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11AP62491 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11AP62491 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11AP62491 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11AP62491 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11AP62491 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11AP62491 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11AP62491 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11AP62491 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11AP62491 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11AP62491 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11AP62491 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11AP62491 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11AP62491 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11AP62491 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11AP62491 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11AP62491 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11AP62491 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11AP62491 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB11AP62491 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11AP62491 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11AP62491 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB11AP62491 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB11AP62491 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11AP62491 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11AP62491 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11AP62491 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11AP62491 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11AP62491 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11AP62491 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11AP62491 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11AP62491 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB11AP62491 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB11AP62491 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11AP62491 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11AP62491 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11AP62491 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11AP62491 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11AP62491 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11AP62491 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11AP62491 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11AP62491 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11AP62491 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11AP62491 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11AP62491 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11AP62491 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11AP62491 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11AP62491 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11AP62491 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11AP62491 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11AP62491 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11AP62491 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11AP62491 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11AP62491 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11AP62491 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11AP62491 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11AP62491 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11AP62491 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11AP62491 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11AP62491 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11AP62491 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11AP62491 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11AP62491 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11AP62491 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11AP62491 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11AP62491 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11AP62491 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11AP62491 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms