Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1CBP62140 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CBP62140 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CBP62140 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CBP62140 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms