Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPZ1P61923 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPZ1P61923 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPZ1P61923 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPZ1P61923 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms