Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TGFB2P61812 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TGFB2P61812 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TGFB2P61812 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TGFB2P61812 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TGFB2P61812 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TGFB2P61812 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms