Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMFBP60983 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMFBP60983 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMFBP60983 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMFBP60983 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMFBP60983 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMFBP60983 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMFBP60983 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMFBP60983 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMFBP60983 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMFBP60983 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMFBP60983 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMFBP60983 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMFBP60983 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMFBP60983 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMFBP60983 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMFBP60983 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GMFBP60983 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMFBP60983 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMFBP60983 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMFBP60983 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMFBP60983 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMFBP60983 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMFBP60983 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMFBP60983 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMFBP60983 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMFBP60983 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMFBP60983 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMFBP60983 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMFBP60983 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMFBP60983 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMFBP60983 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMFBP60983 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMFBP60983 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMFBP60983 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMFBP60983 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMFBP60983 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMFBP60983 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMFBP60983 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GMFBP60983 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMFBP60983 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMFBP60983 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMFBP60983 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMFBP60983 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GMFBP60983 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMFBP60983 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMFBP60983 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMFBP60983 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMFBP60983 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMFBP60983 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMFBP60983 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMFBP60983 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMFBP60983 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMFBP60983 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMFBP60983 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMFBP60983 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMFBP60983 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMFBP60983 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMFBP60983 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMFBP60983 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMFBP60983 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMFBP60983 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMFBP60983 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMFBP60983 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMFBP60983 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMFBP60983 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMFBP60983 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMFBP60983 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMFBP60983 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMFBP60983 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMFBP60983 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMFBP60983 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMFBP60983 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMFBP60983 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMFBP60983 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMFBP60983 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMFBP60983 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMFBP60983 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GMFBP60983 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMFBP60983 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GMFBP60983 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms