Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP3S2P59780 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S2P59780 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3S2P59780 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3S2P59780 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms