Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PROK1P58294 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PROK1P58294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PROK1P58294 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROK1P58294 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROK1P58294 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PROK1P58294 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PROK1P58294 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROK1P58294 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROK1P58294 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PROK1P58294 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROK1P58294 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROK1P58294 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PROK1P58294 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROK1P58294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROK1P58294 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROK1P58294 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROK1P58294 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROK1P58294 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PROK1P58294 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROK1P58294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PROK1P58294 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROK1P58294 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROK1P58294 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROK1P58294 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROK1P58294 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PROK1P58294 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROK1P58294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROK1P58294 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROK1P58294 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PROK1P58294 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PROK1P58294 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROK1P58294 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PROK1P58294 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PROK1P58294 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROK1P58294 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROK1P58294 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROK1P58294 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROK1P58294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROK1P58294 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PROK1P58294 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PROK1P58294 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROK1P58294 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROK1P58294 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PROK1P58294 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PROK1P58294 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PROK1P58294 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PROK1P58294 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PROK1P58294 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROK1P58294 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROK1P58294 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PROK1P58294 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PROK1P58294 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PROK1P58294 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROK1P58294 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PROK1P58294 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROK1P58294 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROK1P58294 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROK1P58294 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PROK1P58294 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROK1P58294 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROK1P58294 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROK1P58294 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PROK1P58294 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PROK1P58294 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PROK1P58294 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PROK1P58294 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PROK1P58294 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PROK1P58294 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PROK1P58294 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PROK1P58294 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PROK1P58294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PROK1P58294 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PROK1P58294 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PROK1P58294 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PROK1P58294 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PROK1P58294 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms