Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GEMIN4P57678 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GEMIN4P57678 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GEMIN4P57678 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEMIN4P57678 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GEMIN4P57678 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEMIN4P57678 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms