Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAND1P57086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAND1P57086 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAND1P57086 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCAND1P57086 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAND1P57086 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAND1P57086 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAND1P57086 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAND1P57086 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAND1P57086 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms