Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBASH3AP57075 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBASH3AP57075 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBASH3AP57075 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBASH3AP57075 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBASH3AP57075 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBASH3AP57075 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBASH3AP57075 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms