Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX17P56962 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX17P56962 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX17P56962 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX17P56962 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX17P56962 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX17P56962 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX17P56962 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STX17P56962 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
STX17P56962 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX17P56962 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX17P56962 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX17P56962 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STX17P56962 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STX17P56962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
STX17P56962 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STX17P56962 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX17P56962 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX17P56962 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX17P56962 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STX17P56962 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX17P56962 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX17P56962 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX17P56962 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX17P56962 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX17P56962 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX17P56962 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX17P56962 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STX17P56962 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
STX17P56962 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STX17P56962 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STX17P56962 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX17P56962 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STX17P56962 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX17P56962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX17P56962 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX17P56962 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX17P56962 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX17P56962 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX17P56962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX17P56962 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STX17P56962 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX17P56962 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX17P56962 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX17P56962 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STX17P56962 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX17P56962 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX17P56962 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STX17P56962 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX17P56962 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX17P56962 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX17P56962 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX17P56962 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX17P56962 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX17P56962 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX17P56962 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX17P56962 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STX17P56962 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX17P56962 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX17P56962 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STX17P56962 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX17P56962 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX17P56962 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STX17P56962 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX17P56962 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STX17P56962 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX17P56962 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX17P56962 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX17P56962 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX17P56962 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STX17P56962 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX17P56962 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STX17P56962 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX17P56962 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX17P56962 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX17P56962 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX17P56962 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STX17P56962 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX17P56962 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX17P56962 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX17P56962 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STX17P56962 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX17P56962 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX17P56962 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX17P56962 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX17P56962 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX17P56962 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX17P56962 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX17P56962 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX17P56962 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX17P56962 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
STX17P56962 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STX17P56962 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STX17P56962 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STX17P56962 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX17P56962 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms