Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFV3P56181 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFV3P56181 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms