Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAX9P55771 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAX9P55771 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAX9P55771 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX9P55771 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAX9P55771 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX9P55771 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX9P55771 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX9P55771 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX9P55771 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAX9P55771 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX9P55771 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX9P55771 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX9P55771 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX9P55771 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAX9P55771 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAX9P55771 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX9P55771 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX9P55771 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX9P55771 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX9P55771 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX9P55771 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAX9P55771 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX9P55771 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX9P55771 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX9P55771 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAX9P55771 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX9P55771 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAX9P55771 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX9P55771 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAX9P55771 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX9P55771 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX9P55771 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX9P55771 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAX9P55771 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX9P55771 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX9P55771 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAX9P55771 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX9P55771 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAX9P55771 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX9P55771 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX9P55771 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAX9P55771 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAX9P55771 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX9P55771 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX9P55771 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX9P55771 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX9P55771 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX9P55771 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX9P55771 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX9P55771 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX9P55771 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX9P55771 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX9P55771 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX9P55771 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX9P55771 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX9P55771 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX9P55771 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX9P55771 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX9P55771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX9P55771 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX9P55771 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX9P55771 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX9P55771 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX9P55771 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX9P55771 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX9P55771 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX9P55771 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX9P55771 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX9P55771 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX9P55771 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX9P55771 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX9P55771 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX9P55771 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX9P55771 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX9P55771 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX9P55771 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX9P55771 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX9P55771 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX9P55771 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX9P55771 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX9P55771 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX9P55771 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX9P55771 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX9P55771 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX9P55771 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms