Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
AFDNP55196 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AFDNP55196 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
AFDNP55196 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AFDNP55196 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AFDNP55196 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AFDNP55196 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AFDNP55196 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AFDNP55196 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFDNP55196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFDNP55196 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFDNP55196 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFDNP55196 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFDNP55196 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AFDNP55196 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
AFDNP55196 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AFDNP55196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
AFDNP55196 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AFDNP55196 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AFDNP55196 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
AFDNP55196 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AFDNP55196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
AFDNP55196 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AFDNP55196 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
AFDNP55196 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
AFDNP55196 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
AFDNP55196 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
AFDNP55196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
AFDNP55196 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AFDNP55196 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
AFDNP55196 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
AFDNP55196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
AFDNP55196 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AFDNP55196 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AFDNP55196 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AFDNP55196 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AFDNP55196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AFDNP55196 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AFDNP55196 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AFDNP55196 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AFDNP55196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AFDNP55196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AFDNP55196 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
AFDNP55196 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AFDNP55196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
AFDNP55196 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AFDNP55196 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
AFDNP55196 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
AFDNP55196 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AFDNP55196 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AFDNP55196 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AFDNP55196 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AFDNP55196 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
AFDNP55196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
AFDNP55196 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
AFDNP55196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AFDNP55196 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
AFDNP55196 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
AFDNP55196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
AFDNP55196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
AFDNP55196 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
AFDNP55196 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AFDNP55196 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AFDNP55196 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
AFDNP55196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
AFDNP55196 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
AFDNP55196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AFDNP55196 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
AFDNP55196 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
AFDNP55196 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
AFDNP55196 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
AFDNP55196 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
AFDNP55196 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
AFDNP55196 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
AFDNP55196 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
AFDNP55196 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
AFDNP55196 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
AFDNP55196 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AFDNP55196 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
AFDNP55196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
AFDNP55196 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFDNP55196 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFDNP55196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFDNP55196 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
AFDNP55196 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AFDNP55196 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AFDNP55196 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
AFDNP55196 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AFDNP55196 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
AFDNP55196 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
AFDNP55196 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
AFDNP55196 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
AFDNP55196 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
AFDNP55196 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms