Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TERF1P54274 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TERF1P54274 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TERF1P54274 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TERF1P54274 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TERF1P54274 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TERF1P54274 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TERF1P54274 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TERF1P54274 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TERF1P54274 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TERF1P54274 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TERF1P54274 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TERF1P54274 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TERF1P54274 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TERF1P54274 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TERF1P54274 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TERF1P54274 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TERF1P54274 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TERF1P54274 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TERF1P54274 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TERF1P54274 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TERF1P54274 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TERF1P54274 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TERF1P54274 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TERF1P54274 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TERF1P54274 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TERF1P54274 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TERF1P54274 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TERF1P54274 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TERF1P54274 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TERF1P54274 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TERF1P54274 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TERF1P54274 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TERF1P54274 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TERF1P54274 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TERF1P54274 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TERF1P54274 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TERF1P54274 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TERF1P54274 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TERF1P54274 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TERF1P54274 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TERF1P54274 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TERF1P54274 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TERF1P54274 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TERF1P54274 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TERF1P54274 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TERF1P54274 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TERF1P54274 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TERF1P54274 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TERF1P54274 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TERF1P54274 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TERF1P54274 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TERF1P54274 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TERF1P54274 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TERF1P54274 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TERF1P54274 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TERF1P54274 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TERF1P54274 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TERF1P54274 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TERF1P54274 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TERF1P54274 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TERF1P54274 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TERF1P54274 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TERF1P54274 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TERF1P54274 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TERF1P54274 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TERF1P54274 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TERF1P54274 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TERF1P54274 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TERF1P54274 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TERF1P54274 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TERF1P54274 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TERF1P54274 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TERF1P54274 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TERF1P54274 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TERF1P54274 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TERF1P54274 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TERF1P54274 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TERF1P54274 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TERF1P54274 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TERF1P54274 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TERF1P54274 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TERF1P54274 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TERF1P54274 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TERF1P54274 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TERF1P54274 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TERF1P54274 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TERF1P54274 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TERF1P54274 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TERF1P54274 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TERF1P54274 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TERF1P54274 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TERF1P54274 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TERF1P54274 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TERF1P54274 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TERF1P54274 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TERF1P54274 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TERF1P54274 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TERF1P54274 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TERF1P54274 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms