Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP1P53367 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP1P53367 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARFIP1P53367 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms