Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRP3P50461 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRP3P50461 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRP3P50461 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSRP3P50461 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms