Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IDH3AP50213 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IDH3AP50213 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IDH3AP50213 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IDH3AP50213 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IDH3AP50213 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms