Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNTAP49354 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTAP49354 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNTAP49354 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNTAP49354 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNTAP49354 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTAP49354 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTAP49354 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTAP49354 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTAP49354 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTAP49354 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNTAP49354 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNTAP49354 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNTAP49354 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FNTAP49354 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNTAP49354 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNTAP49354 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNTAP49354 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNTAP49354 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FNTAP49354 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTAP49354 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FNTAP49354 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNTAP49354 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNTAP49354 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNTAP49354 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNTAP49354 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNTAP49354 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNTAP49354 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FNTAP49354 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FNTAP49354 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FNTAP49354 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FNTAP49354 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTAP49354 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTAP49354 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTAP49354 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTAP49354 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNTAP49354 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FNTAP49354 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTAP49354 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTAP49354 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTAP49354 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTAP49354 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTAP49354 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FNTAP49354 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTAP49354 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTAP49354 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTAP49354 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTAP49354 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTAP49354 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNTAP49354 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNTAP49354 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNTAP49354 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FNTAP49354 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FNTAP49354 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FNTAP49354 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNTAP49354 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNTAP49354 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNTAP49354 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTAP49354 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTAP49354 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTAP49354 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTAP49354 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTAP49354 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTAP49354 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTAP49354 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTAP49354 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTAP49354 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTAP49354 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTAP49354 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTAP49354 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTAP49354 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FNTAP49354 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FNTAP49354 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FNTAP49354 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTAP49354 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTAP49354 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTAP49354 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTAP49354 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTAP49354 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTAP49354 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTAP49354 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTAP49354 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTAP49354 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTAP49354 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTAP49354 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNTAP49354 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNTAP49354 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms