Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLC4A3P48751 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC4A3P48751 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLC4A3P48751 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLC4A3P48751 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLC4A3P48751 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SLC4A3P48751 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms