Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PREPP48147 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PREPP48147 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PREPP48147 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREPP48147 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREPP48147 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREPP48147 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREPP48147 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREPP48147 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PREPP48147 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREPP48147 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREPP48147 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREPP48147 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PREPP48147 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PREPP48147 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PREPP48147 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREPP48147 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PREPP48147 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PREPP48147 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PREPP48147 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREPP48147 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREPP48147 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PREPP48147 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PREPP48147 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PREPP48147 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PREPP48147 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PREPP48147 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PREPP48147 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PREPP48147 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREPP48147 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREPP48147 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREPP48147 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREPP48147 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREPP48147 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PREPP48147 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PREPP48147 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PREPP48147 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PREPP48147 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PREPP48147 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PREPP48147 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PREPP48147 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PREPP48147 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PREPP48147 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PREPP48147 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PREPP48147 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREPP48147 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREPP48147 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREPP48147 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREPP48147 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PREPP48147 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREPP48147 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREPP48147 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PREPP48147 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PREPP48147 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PREPP48147 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREPP48147 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREPP48147 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREPP48147 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREPP48147 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREPP48147 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PREPP48147 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREPP48147 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREPP48147 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREPP48147 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREPP48147 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PREPP48147 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PREPP48147 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PREPP48147 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PREPP48147 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PREPP48147 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PREPP48147 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms