Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms