Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR4P46093 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR4P46093 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR4P46093 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR4P46093 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR4P46093 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR4P46093 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR4P46093 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR4P46093 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR4P46093 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPR4P46093 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR4P46093 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR4P46093 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR4P46093 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR4P46093 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR4P46093 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR4P46093 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR4P46093 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPR4P46093 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR4P46093 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR4P46093 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR4P46093 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPR4P46093 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPR4P46093 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR4P46093 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR4P46093 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR4P46093 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR4P46093 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPR4P46093 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPR4P46093 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPR4P46093 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPR4P46093 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPR4P46093 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPR4P46093 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPR4P46093 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPR4P46093 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPR4P46093 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPR4P46093 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPR4P46093 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPR4P46093 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPR4P46093 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPR4P46093 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPR4P46093 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPR4P46093 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPR4P46093 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPR4P46093 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPR4P46093 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR4P46093 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR4P46093 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR4P46093 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPR4P46093 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR4P46093 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR4P46093 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPR4P46093 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GPR4P46093 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR4P46093 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR4P46093 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR4P46093 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR4P46093 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPR4P46093 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR4P46093 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR4P46093 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR4P46093 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR4P46093 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR4P46093 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPR4P46093 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR4P46093 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR4P46093 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPR4P46093 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR4P46093 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPR4P46093 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR4P46093 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR4P46093 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR4P46093 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR4P46093 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPR4P46093 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPR4P46093 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPR4P46093 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR4P46093 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR4P46093 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR4P46093 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPR4P46093 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR4P46093 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPR4P46093 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms