Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ETV4P43268 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ETV4P43268 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ETV4P43268 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ETV4P43268 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ETV4P43268 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ETV4P43268 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ETV4P43268 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ETV4P43268 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ETV4P43268 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ETV4P43268 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ETV4P43268 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ETV4P43268 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ETV4P43268 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ETV4P43268 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ETV4P43268 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ETV4P43268 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ETV4P43268 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ETV4P43268 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ETV4P43268 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ETV4P43268 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ETV4P43268 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ETV4P43268 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ETV4P43268 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ETV4P43268 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ETV4P43268 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ETV4P43268 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ETV4P43268 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ETV4P43268 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ETV4P43268 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ETV4P43268 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ETV4P43268 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ETV4P43268 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ETV4P43268 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ETV4P43268 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ETV4P43268 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ETV4P43268 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ETV4P43268 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ETV4P43268 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ETV4P43268 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ETV4P43268 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ETV4P43268 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ETV4P43268 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ETV4P43268 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ETV4P43268 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ETV4P43268 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ETV4P43268 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ETV4P43268 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ETV4P43268 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ETV4P43268 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ETV4P43268 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ETV4P43268 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ETV4P43268 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ETV4P43268 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ETV4P43268 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ETV4P43268 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ETV4P43268 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ETV4P43268 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ETV4P43268 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ETV4P43268 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ETV4P43268 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ETV4P43268 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ETV4P43268 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ETV4P43268 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETV4P43268 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETV4P43268 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETV4P43268 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETV4P43268 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETV4P43268 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ETV4P43268 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ETV4P43268 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ETV4P43268 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ETV4P43268 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ETV4P43268 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ETV4P43268 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETV4P43268 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETV4P43268 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ETV4P43268 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ETV4P43268 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ETV4P43268 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETV4P43268 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ETV4P43268 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ETV4P43268 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETV4P43268 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ETV4P43268 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETV4P43268 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ETV4P43268 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms