Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2AP42771 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2AP42771 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AP42771 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms