Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAA2P42765 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAA2P42765 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACAA2P42765 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACAA2P42765 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms