Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDNFP39905 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDNFP39905 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDNFP39905 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDNFP39905 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDNFP39905 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDNFP39905 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDNFP39905 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDNFP39905 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDNFP39905 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDNFP39905 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDNFP39905 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDNFP39905 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDNFP39905 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDNFP39905 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDNFP39905 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDNFP39905 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDNFP39905 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDNFP39905 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDNFP39905 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDNFP39905 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDNFP39905 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDNFP39905 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDNFP39905 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDNFP39905 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDNFP39905 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDNFP39905 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDNFP39905 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDNFP39905 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDNFP39905 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDNFP39905 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDNFP39905 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDNFP39905 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDNFP39905 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDNFP39905 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDNFP39905 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDNFP39905 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDNFP39905 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDNFP39905 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDNFP39905 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDNFP39905 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDNFP39905 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDNFP39905 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDNFP39905 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDNFP39905 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDNFP39905 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDNFP39905 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDNFP39905 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDNFP39905 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDNFP39905 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDNFP39905 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDNFP39905 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDNFP39905 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDNFP39905 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDNFP39905 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDNFP39905 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDNFP39905 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDNFP39905 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDNFP39905 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDNFP39905 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDNFP39905 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDNFP39905 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDNFP39905 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDNFP39905 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDNFP39905 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDNFP39905 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDNFP39905 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDNFP39905 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDNFP39905 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDNFP39905 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDNFP39905 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDNFP39905 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDNFP39905 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDNFP39905 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDNFP39905 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDNFP39905 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDNFP39905 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDNFP39905 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDNFP39905 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDNFP39905 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDNFP39905 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDNFP39905 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.3 ms