Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX11P35716 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX11P35716 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX11P35716 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX11P35716 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX11P35716 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX11P35716 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX11P35716 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX11P35716 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX11P35716 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX11P35716 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX11P35716 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX11P35716 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX11P35716 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX11P35716 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX11P35716 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX11P35716 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX11P35716 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX11P35716 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX11P35716 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX11P35716 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX11P35716 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX11P35716 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX11P35716 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX11P35716 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX11P35716 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX11P35716 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX11P35716 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX11P35716 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX11P35716 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX11P35716 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX11P35716 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX11P35716 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX11P35716 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX11P35716 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX11P35716 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX11P35716 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX11P35716 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX11P35716 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX11P35716 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX11P35716 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX11P35716 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX11P35716 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX11P35716 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX11P35716 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX11P35716 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX11P35716 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX11P35716 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX11P35716 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX11P35716 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX11P35716 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX11P35716 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX11P35716 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX11P35716 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX11P35716 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX11P35716 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX11P35716 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX11P35716 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX11P35716 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX11P35716 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX11P35716 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX11P35716 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX11P35716 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOX11P35716 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX11P35716 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX11P35716 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX11P35716 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX11P35716 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX11P35716 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX11P35716 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX11P35716 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX11P35716 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX11P35716 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX11P35716 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms