Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN1P35523 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLCN1P35523 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN1P35523 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLCN1P35523 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLCN1P35523 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms