Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX6P30041 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX6P30041 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX6P30041 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDX6P30041 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDX6P30041 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDX6P30041 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX6P30041 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX6P30041 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms