Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFS1P28331 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFS1P28331 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFS1P28331 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFS1P28331 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFS1P28331 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms