Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
DNMT1P26358 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
DNMT1P26358 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
DNMT1P26358 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
DNMT1P26358 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
DNMT1P26358 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
DNMT1P26358 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms