Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAMP1P23763 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAMP1P23763 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VAMP1P23763 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAMP1P23763 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP1P23763 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP1P23763 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP1P23763 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP1P23763 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP1P23763 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAMP1P23763 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAMP1P23763 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP1P23763 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP1P23763 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP1P23763 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAMP1P23763 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAMP1P23763 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAMP1P23763 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP1P23763 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAMP1P23763 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP1P23763 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP1P23763 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP1P23763 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP1P23763 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP1P23763 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAMP1P23763 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAMP1P23763 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms