Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRBP23467 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRBP23467 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRBP23467 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRBP23467 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRBP23467 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRBP23467 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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