Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR4A1P22736 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR4A1P22736 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR4A1P22736 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A1P22736 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms