Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI1P19237 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNI1P19237 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI1P19237 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNI1P19237 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNI1P19237 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNI1P19237 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNI1P19237 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms