Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNB2P17787 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHRNB2P17787 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB2P17787 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNB2P17787 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNB2P17787 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms