Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB6P17509 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB6P17509 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB6P17509 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms