Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VEGFAP15692 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
VEGFAP15692 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
VEGFAP15692 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
VEGFAP15692 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
VEGFAP15692 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VEGFAP15692 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VEGFAP15692 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
VEGFAP15692 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms