Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNB1P11230 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNB1P11230 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNB1P11230 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNB1P11230 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNB1P11230 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNB1P11230 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms