Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR2F1P10589 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NR2F1P10589 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR2F1P10589 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR2F1P10589 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms